Kenmerk van het anaërobe systeem is dat organisch materiaal in het afvalwater zonder de aanwezigheid van lucht wordt verminderd. In deze situatie wordt het organische materiaal verminderd door biogas, dat voor energie opwekking kan worden gebruikt. De efficiency, in termen van CZV, van een anaëroob systeem variëert van 75% tot 90%. De vermindering van Stikstof is vrij laag. De anaërobe behandeling is geschikt voor bedrijven met hoog verontreinigd afvalwater, dat hoofdzakelijk opgeloste stoffen bevat. De slibproductie van een anaërobe zuivering is zeer laag.